linprotomol - Revision 103: /framework/integrators

• ..
• .IntegratorLIB.i.swp
• .LeapfrogIntegrator.cpp.swp
• .StandardIntegrator.cpp.swp
• .cvsignore
• BBK.py
• BBKCoarseIntegrator.cpp
• BBKCoarseIntegrator.h
• BBKIntegrator.cpp
• BBKIntegrator.h
• BBKIntegrator.i
• BSplineMOLLYIntegrator.cpp
• BSplineMOLLYIntegrator.h
• BSplineMOLLYIntegrator.i
• BerendsenIntegrator.cpp
• BerendsenIntegrator.h
• BsplineMolly.py
• CGMinimizerIntegrator.cpp
• CGMinimizerIntegrator.h
• DLMCIntegrator.cpp
• DLMCIntegrator.h
• DMDLeapfrogIntegrator.cpp
• DMDLeapfrogIntegrator.h
• DMDLeapfrogIntegrator.i
• DihedralHMCIntegrator.cpp
• DihedralHMCIntegrator.h
• EquilibriumMOLLYIntegrator.cpp
• EquilibriumMOLLYIntegrator.h
• EquilibriumMOLLYIntegrator.i
• EquilibriumMolly.py
• HMC.py
• HMCIntegrator.cpp
• HMCIntegrator.h
• HMCIntegrator.i
• Hessian.cpp
• Hessian.h
• HessianInt.cpp
• HessianInt.h
• Impulse.py
• ImpulseIntegrator.cpp
• ImpulseIntegrator.h
• ImpulseIntegrator.i
• Integrator.cpp
• Integrator.h
• IntegratorDefinition.cpp
• IntegratorDefinition.h
• IntegratorLIB.i
• LangevinImpulse.py
• LangevinImpulseIntegrator.cpp
• LangevinImpulseIntegrator.cpp.old
• LangevinImpulseIntegrator.h
• LangevinImpulseIntegrator.h.old
• LangevinImpulseIntegrator.i
• Leapfrog.py
• LeapfrogIntCrs.cpp
• LeapfrogIntegrator.cpp
• LeapfrogIntegrator.h
• LeapfrogIntegrator.i
• LeapfrogTruncatedShadow.cpp
• LeapfrogTruncatedShadow.h
• MCIntegrator.cpp
• MCIntegrator.h
• MCIntegrator.i
• MOLLYIntegrator.cpp
• MOLLYIntegrator.h
• MOLLYIntegrator.i
• MTSIntegrator.cpp
• MTSIntegrator.h
• MTSIntegrator.i
• Makefile.am
• Makefile.bak
• Modifier.h
• ModifierAveraging.h
• ModifierBerendsen.h
• ModifierFriction.h
• ModifierIncrementTimestep.h
• ModifierMetaRattle.cpp
• ModifierMetaRattle.h
• ModifierMetaRattleShake.cpp
• ModifierMetaRattleShake.h
• ModifierMetaShake.cpp
• ModifierMetaShake.h
• ModifierMollification.h
• ModifierNPTRattle.cpp
• ModifierNPTRattle.h
• ModifierNPTShake.cpp
• ModifierNPTShake.h
• ModifierNVTRattle.cpp
• ModifierNVTRattle.h
• ModifierNVTShake.cpp
• ModifierNVTShake.h
• ModifierPostForceBarostat.h
• ModifierPostForceThermostat.h
• ModifierPreForceBarostat.h
• ModifierPreForceThermostat.h
• ModifierRattle.cpp
• ModifierRattle.h
• ModifierRemoveAngularMomentum.h
• ModifierRemoveLinearMomentum.h
• ModifierShadow.cpp
• ModifierShadow.h
• ModifierShadow.i
• ModifierShake.cpp
• ModifierShake.h
• NPTVerlet.py
• NPTVerletIntegrator.cpp
• NPTVerletIntegrator.h
• NPTVerletIntegrator.i
• NVTVerlet.py
• NVTVerletIntegrator.cpp
• NVTVerletIntegrator.h
• NVTVerletIntegrator.i
• NonStandardIntegrator.h
• NormModeCoarse.cpp
• NormModeCoarse.h
• NormModeCoarse.i
• NormModeDiag.cpp
• NormModeDiag.h
• NormModeInt.cpp
• NormModeInt.h
• NormModeInt.i
• NormModeMin.cpp
• NormModeMin.h
• NormModeMin.i
• NormModeNVEInt.cpp
• NormModeNewt.cpp
• NormModeResInt.cpp
• NormModeResInt.h
• NormModeResMin.cpp
• NormModeResMin.h
• NormModeResMin.i
• NormModeSampling.cpp
• NormModeSampling.h
• NormModeSampling.i
• NormModeSamplingMin.cpp
• NormModeSamplingMin.h
• NormModeSamplingMin.i
• NormModeSmplMin.cpp
• NormModeSmplMin.h
• NormModeVisual.cpp
• NormModeVisual.h
• NoseHoover.py
• NoseNVTLeapfrogIntegrator.cpp
• NoseNVTLeapfrogIntegrator.h
• NoseNVTLeapfrogIntegrator.i
• PLeapfrogIntegrator.cpp
• PLeapfrogIntegrator.h
• PLeapfrogIntegrator.i
• PaulTrapIntegrator.cpp
• PaulTrapIntegrator.h
• PaulTrapIntegrator.i
• PositionVerlet.py
• RMTIntegrator.cpp
• RMTIntegrator.h
• STSIntegrator.cpp
• STSIntegrator.h
• STSIntegrator.i
• SelfconsistentLeapfrog.py
• ShadowHMC.py
• ShadowHMCIntegrator.cpp
• ShadowHMCIntegrator.h
• ShadowHMCIntegrator.i
• StandardIntegrator.cpp
• StandardIntegrator.h
• Umbrella.py
• UmbrellaIntegrator.cpp
• UmbrellaIntegrator.h
• UmbrellaIntegrator.i
• oldnormmode/
• trevor
• trevor1
• trevor2