m-bison - Revision 133: /trunk/R

• ..
• CcorrProf.MBparams.MBnetwork.MBdataDE.MBgibbsPars.R
• CcorrProf.R
• CcrossValid.MBparams.MBnetwork.MBdataDE.MBgibbsPars.R
• CcrossValid.R
• CcrossValidLik.MBparams.MBnetwork.MBdataDE.MBgibbsPars.R
• CcrossValidLik.R
• CgibbsSampler.MBnetwork.MBparams.MBgibbsPars.R
• CgibbsSampler.R
• CgreedySearch.MBparams.MBnetwork.MBdataDE.MBgibbsPars.R
• CgreedySearch.R
• CpermSigGene.MBparams.MBnetwork.MBdataDE.MBgibbsPars.R
• CpermSigGene.MBparams.MBnetwork.MBgibbsPars.R
• CpermSigGene.R
• CpermSigKnow.MBparams.MBnetwork.MBdataDE.MBgibbsPars.R
• CpermSigKnow.MBparams.MBnetwork.MBgibbsPars.R
• CpermSigKnow.R
• CpermSigMeta.MBparams.MBnetwork.MBdataDE.MBgibbsPars.R
• CpermSigMeta.R
• CpriorEnrich.MBparams.MBnetwork.MBdataDE.MBgibbsPars.R
• CpriorEnrich.R
• CrocAuc.MBparams.MBnetwork.MBdataDE.MBgibbsPars.R
• CrocAuc.R
• CsampleNIter.MBnetwork.MBparams.R
• CsampleNIter.R
• Csim.binary.R
• Csim.conn.GS.R
• Csim.go.R
• addData.MBdataDE.R
• addData.R
• addGenes.MBdataKS.MBdataDE.R
• addGenes.MBdataKS.R
• addGenes.R
• addNodes.MBnetwork.R
• addNodes.R
• addParams.MBparams.R
• addParams.R
• calc.all.pms.R
• calc.graph.pars.R
• calc.graph.pars.fast.R
• calc.graph.pars.old.R
• calc.pms.pllel.R
• calc.t.CPD.R
• calcCPDs.MBnetwork.MBdataDE.R
• calcCPDs.R
• calcLods.MBnetwork.R
• calcLods.R
• calcMargs.MBnetwork.R
• calcMargs.R
• calcSim.MBparams.MBdataKS.R
• calcSim.MBparams.R
• calcSim.R
• calcTruth.MBdataDE.R
• calcTruth.R
• compatObjects.MBnetwork.MBparams.R
• compatObjects.MBparams.MBnetwork.R
• compatObjects.N.R
• compatObjects.R
• drawStory.MBnetwork.MBparams.R
• drawStory.MBparams.R
• drawStory.R
• filegen.pms.pllel.R
• geom.graph.test.R
• get.go.map.R
• get.go.ontos.R
• get.go.root.R
• get.metadata.R
• getAssoc.MBdataKS.R
• getAssoc.R
• graph2igraph.R
• igraph2graph.R
• initCounts.MBnetwork.R
• initCounts.R
• kl.divergence.R
• modify.meta.list.R
• randInit.MBnetwork.R
• randInit.MBparams.R
• randInit.R
• remove.meta.chars.R
• setBurn.MBgibbsPars.R
• setBurn.R
• setChains.MBgibbsPars.R
• setChains.R
• setGSmethod.MBgibbsPars.R
• setGSmethod.R
• setKLrepeat.MBgibbsPars.R
• setKLrepeat.R
• setLMmethod.MBdataDE.R
• setLMmethod.R
• setPrior.MBparams.MBdataDE.R
• setPrior.MBparams.R
• setPrior.R
• setProp.MBdataDE.R
• setProp.R
• setSamp.MBgibbsPars.R
• setSamp.R
• setSlice.MBgibbsPars.R
• setSlice.R
• setThresh.MBgibbsPars.R
• setThresh.R
• setValue.MBparams.R
• setValue.R
• setValues.MBparams.R
• setValues.R
• setZero.MBparams.R
• setZero.R
• setZeros.MBparams.R
• setZeros.R
• sim.conn.GRG.R
• sim.conn.R
• sim.data.GS.R
• sim.data.R
• sim.thresh.R
• trimParams.MBparams.MBdataDE.R
• trimParams.R
• validMBdataDE.R
• validMBdataKS.R
• validMBgibbsPars.R
• validMBnetwork.R
• validMBparams.R
• zzz.R