>>>>>> GrSystem: init >>>>>> PmSystem: ctor >>>>>> PmSystem: init >>>>>> GrWindow::create: glut window [Protein Modeler] >>>> glut window id [1] >>> use_graphics [1] pm> >>>>>> GlutWinExpose: win [105603e8] g_curr_win [-1] >>> data[d1] pm> #============================================================# pm> # test reading 2nd structure # pm> # # pm> # show topology. # pm> #============================================================# pm> # set units pm> units ---------------- energy ---------------- >>>>>> name [Joule] >>>>>> scale [1] >>>>>> value [1.66054e-21 J] ---------------- length ---------------- >>>>>> name [nanometer] >>>>>> scale [1] >>>>>> value [1e-09 m] ---------------- mass ---------------- >>>>>> name [amu] >>>>>> scale [1] >>>>>> value [1.66054e-27 kg] ---------------- temperature ---------------- >>>>>> name [Kelvin] >>>>>> scale [1] >>>>>> value [298.15 K] ---------------- time ---------------- >>>>>> name [picosecond] >>>>>> scale [1] >>>>>> value [1e-12 s] ---------------- reduced units ---------------- >>>>>> eta [602.214] >>>>>> kb [0.00831657] >>>>>> kT [2.47959] pm> units scale name = mass uname = reducedMass value = 10000.0 pm> # open pdb file pm> database open name = db1 format = pdb file = ../data/1W7I.pdb >>> PDB: open [../data/1W7I.pdb] for reading. >>> read pdb file ... done. >>> read 1 protein model(s) 1 nucleotide model(s) 0 misc model(s) ------------ protein ------------ >>> 6872 atoms 2 chains --------- chains --------- 1 id = A number of residues = 750 2 id = B number of residues = 145 ------------ nucleotide ------------ >>> 27 atoms 1 chains --------- chains --------- 1 id = A number of residues = 1 pm> # read molecule pm> molecule read name = m1 database = db1 >>> get mol 1 8 >>> number of molecule atoms = [6872] >>> PmMolecule::set 8 >>> molecule type = protein >>> extent min (-3.1565 -3.5948 -2.534) max (4.0144 4.0653 9.9332) pm> # create a some domains pm> #domain create head = A[2-20] pm> domain create head = A[2-780] pm> domain head backbone color = [ 0.6 0.6 0.6 ] width = 1 show pm> #domain head topology chain = true show pm> domain head topology contact = true show --------- residue contacts = 3466 -------- 1 [A5]: A6 A7 A31 2 [A6]: A5 A7 3 [A7]: A5 A6 A13 A27 A31 A38 A59 A60 A62 A79 4 [A8]: A11 A30 5 [A9]: A10 A30 6 [A10]: A9 A26 7 [A11]: A8 8 [A12]: A14 A24 A26 A63 A66 9 [A13]: A7 A14 A25 A40 A60 A62 10 [A14]: A12 A13 A22 A24 A61 A63 A81 A83 A87 11 [A15]: A16 A25 A40 A42 A50 12 [A16]: A15 A22 A50 13 [A17]: A18 A19 A20 A23 14 [A18]: A17 15 [A19]: A17 A20 16 [A20]: A17 A19 A90 A675 17 [A21]: A22 A86 A675 A676 A679 18 [A22]: A14 A16 A21 A61 A81 A82 A83 A86 19 [A23]: A17 20 [A24]: A12 A14 A63 21 [A25]: A13 A15 A40 22 [A26]: A10 A12 23 [A27]: A7 A38 A40 24 [A28]: A39 A41 A46 25 [A29]: 26 [A30]: A8 A9 27 [A31]: A5 A7 A32 A33 A35 A38 A52 A59 28 [A32]: A31 A33 A35 29 [A33]: A31 A32 30 [A34]: 31 [A35]: A31 A32 32 [A36]: A37 33 [A37]: A36 A39 A49 A51 34 [A38]: A7 A27 A31 A40 A50 A52 A59 A60 35 [A39]: A28 A37 A49 36 [A40]: A13 A15 A25 A27 A38 A48 A50 37 [A41]: A28 38 [A42]: A15 A47 A48 39 [A43]: 40 [A44]: 41 [A45]: 42 [A46]: A28 43 [A47]: A42 44 [A48]: A40 A42 45 [A49]: A37 A39 46 [A50]: A15 A16 A38 A40 A51 A52 A60 47 [A51]: A37 A50 48 [A52]: A31 A38 A50 A59 49 [A53]: A54 A55 A56 A58 50 [A54]: A53 51 [A55]: A53 52 [A56]: A53 A58 53 [A57]: 54 [A58]: A53 A56 55 [A59]: A7 A31 A38 A52 A60 56 [A60]: A7 A13 A38 A50 A59 A61 57 [A61]: A14 A22 A60 A81 A83 58 [A62]: A7 A13 A79 59 [A63]: A12 A14 A24 A64 A66 A69 A87 60 [A64]: A63 A65 A68 A77 A79 A84 61 [A65]: A64 A68 A79 A760 62 [A66]: A12 A63 A69 63 [A67]: A68 A710 A760 A763 64 [A68]: A64 A65 A67 A71 A77 A756 A760 65 [A69]: A63 A66 A87 A88 A91 66 [A70]: 67 [A71]: A68 A72 A76 68 [A72]: A71 A92 A136 A137 69 [A73]: A75 A102 70 [A74]: A77 A85 A88 A89 A101 A103 A691 71 [A75]: A73 A694 72 [A76]: A71 73 [A77]: A64 A68 A74 A80 A84 A88 74 [A78]: A79 A756 A757 75 [A79]: A7 A62 A64 A65 A78 A81 A757 76 [A80]: A77 A691 A695 77 [A81]: A14 A22 A61 A79 A83 A84 78 [A82]: A22 A83 A86 A679 A683 A688 79 [A83]: A14 A22 A61 A81 A82 80 [A84]: A64 A77 A81 81 [A85]: A74 A89 A682 A688 A691 82 [A86]: A21 A22 A82 A90 A673 A675 A679 83 [A87]: A14 A63 A69 A90 A91 84 [A88]: A69 A74 A77 A89 A91 A92 85 [A89]: A74 A85 A88 A92 A101 A108 A110 86 [A90]: A20 A86 A87 A91 A94 A673 A675 87 [A91]: A69 A87 A88 A90 A92 A95 88 [A92]: A72 A88 A89 A91 A96 A98 A101 A137 89 [A93]: A94 A99 A110 A112 A664 A671 A673 90 [A94]: A90 A93 A95 A671 A673 91 [A95]: A91 A94 92 [A96]: A92 A98 93 [A97]: A671 94 [A98]: A92 A96 95 [A99]: A93 A100 A112 A116 A671 96 [A100]: A99 A107 A109 A118 A119 A137 A138 A139 A140 A172 A659 97 [A101]: A74 A89 A92 A108 98 [A102]: A73 A107 A132 A137 99 [A103]: A74 A106 A687 A691 100 [A104]: 101 [A105]: 102 [A106]: A103 A465 A658 A660 103 [A107]: A100 A102 A139 A142 A659 104 [A108]: A89 A101 A660 A662 A687 105 [A109]: A100 A661 106 [A110]: A89 A93 A662 A664 A673 107 [A111]: A112 A113 A664 108 [A112]: A93 A99 A111 A113 A116 A671 109 [A113]: A111 A112 A663 A664 A665 A668 A669 A670 110 [A114]: A116 A670 A671 111 [A115]: 112 [A116]: A99 A112 A114 A117 A118 A119 A671 113 [A117]: A116 A118 114 [A118]: A100 A116 A117 A119 A123 A138 115 [A119]: A100 A116 A118 A138 A139 A140 A174 A175 116 [A120]: 117 [A121]: 118 [A122]: A123 119 [A123]: A118 A122 A124 A127 A138 A140 120 [A124]: A123 A125 A140 A178 A179 A182 A183 121 [A125]: A124 122 [A126]: A127 123 [A127]: A123 A126 A130 A135 A136 A138 A140 A141 A179 124 [A128]: A144 A179 A183 125 [A129]: 126 [A130]: A127 A131 A135 127 [A131]: A130 A134 128 [A132]: A102 A145 129 [A133]: 130 [A134]: A131 131 [A135]: A127 A130 A136 132 [A136]: A72 A127 A135 A137 133 [A137]: A72 A92 A100 A102 A136 134 [A138]: A100 A118 A119 A123 A127 A139 A140 135 [A139]: A100 A107 A119 A138 A140 A142 A172 A175 A176 A659 136 [A140]: A100 A119 A123 A124 A127 A138 A139 A175 A179 137 [A141]: A127 138 [A142]: A107 A139 A159 A657 A659 139 [A143]: A179 A180 140 [A144]: A128 A147 A148 A179 A183 141 [A145]: A132 A148 A149 A657 142 [A146]: A157 A159 A180 A433 A657 143 [A147]: A144 A150 A179 A180 A183 A184 A228 A232 144 [A148]: A144 A145 A149 A152 145 [A149]: A145 A148 A152 A153 A157 A655 A657 146 [A150]: A147 A157 A228 A232 A431 A433 147 [A151]: A232 148 [A152]: A148 A149 A153 149 [A153]: A149 A152 A155 150 [A154]: 151 [A155]: A153 A156 A157 A654 A655 152 [A156]: A155 A431 A432 A654 153 [A157]: A146 A149 A150 A155 A433 A655 A657 154 [A158]: A160 A223 A651 A654 155 [A159]: A142 A146 A161 A176 A180 A433 A435 A657 156 [A160]: A158 A436 A461 A464 A651 A656 A658 157 [A161]: A159 A169 A172 A435 A437 A659 A661 158 [A162]: A660 159 [A163]: 160 [A164]: A165 A213 A214 A663 A677 A680 A681 161 [A165]: A164 A214 A217 162 [A166]: 163 [A167]: A169 A661 164 [A168]: 165 [A169]: A161 A167 A437 A661 166 [A170]: A200 A204 A437 167 [A171]: A174 A175 168 [A172]: A100 A139 A161 A659 A661 169 [A173]: A435 170 [A174]: A119 A171 A175 A178 A193 A197 171 [A175]: A119 A139 A140 A171 A174 A178 172 [A176]: A139 A159 A180 173 [A177]: A193 A196 A197 A226 174 [A178]: A124 A174 A175 A193 175 [A179]: A124 A127 A128 A140 A143 A144 A147 A180 A182 A183 176 [A180]: A143 A146 A147 A159 A176 A179 A226 A228 A433 177 [A181]: 178 [A182]: A124 A179 A183 179 [A183]: A124 A128 A144 A147 A179 A182 180 [A184]: A147 A233 A234 181 [A185]: 182 [A186]: A233 183 [A187]: A190 A233 184 [A188]: 185 [A189]: 186 [A190]: A187 A192 187 [A191]: 188 [A192]: A190 A196 A237 189 [A193]: A174 A177 A178 A197 190 [A194]: 191 [A195]: 192 [A196]: A177 A192 A197 A199 A224 A237 193 [A197]: A174 A177 A193 A196 194 [A198]: A314 A315 195 [A199]: A196 A200 A203 A222 A239 A315 A419 196 [A200]: A170 A199 A201 A204 A222 197 [A201]: A200 A202 A204 A307 A311 198 [A202]: A201 A203 A206 A311 A312 A315 A415 A419 199 [A203]: A199 A202 A206 A220 A222 A239 A412 A416 A419 200 [A204]: A170 A200 A201 A208 A216 201 [A205]: A206 A261 A264 A308 202 [A206]: A202 A203 A205 A259 A261 A408 A412 A415 203 [A207]: 204 [A208]: A204 A216 A218 A220 A260 205 [A209]: A219 A248 A259 A260 206 [A210]: A211 A215 A255 A256 A257 A263 A293 A296 207 [A211]: A210 A212 A214 A217 A219 A248 A256 208 [A212]: A211 A213 A256 A444 209 [A213]: A164 A212 A444 A677 A680 210 [A214]: A164 A165 A211 A217 211 [A215]: A210 A296 212 [A216]: A204 A208 A260 213 [A217]: A165 A211 A214 A219 214 [A218]: A208 A220 215 [A219]: A209 A211 A217 A245 A248 A259 A439 A442 A454 216 [A220]: A203 A208 A218 A222 A241 A244 A259 A412 217 [A221]: 218 [A222]: A199 A200 A203 A220 A224 A239 A437 219 [A223]: A158 A225 A240 A242 A432 A436 A647 A650 A651 220 [A224]: A196 A222 A239 A435 221 [A225]: A223 A238 A240 A432 222 [A226]: A177 A180 A228 A237 A433 223 [A227]: 224 [A228]: A147 A150 A180 A226 A232 A234 A235 A433 225 [A229]: A231 A232 A233 A235 226 [A230]: A430 227 [A231]: A229 228 [A232]: A147 A150 A151 A228 A229 A430 A431 229 [A233]: A184 A186 A187 A229 A234 A235 230 [A234]: A184 A228 A233 231 [A235]: A228 A229 A233 A425 A427 A429 232 [A236]: 233 [A237]: A192 A196 A226 234 [A238]: A225 A240 A420 A424 235 [A239]: A199 A203 A222 A224 A241 A416 A419 A420 236 [A240]: A223 A225 A238 A242 A432 A650 237 [A241]: A220 A239 A242 A412 A416 238 [A242]: A223 A240 A241 A243 A436 A643 A646 A647 A650 A651 239 [A243]: A242 A439 A457 A640 A643 A644 A647 240 [A244]: A220 A246 A259 A408 A412 241 [A245]: A219 A247 A248 A259 A450 242 [A246]: A244 A405 A409 A570 A636 A639 243 [A247]: A245 A449 A450 A567 A636 244 [A248]: A209 A211 A219 A245 A252 A256 A258 A259 A450 245 [A249]: A250 A258 A259 A262 A287 A332 A405 A408 246 [A250]: A249 A287 A401 A405 247 [A251]: A252 A253 A290 A450 A567 248 [A252]: A248 A251 A258 A263 A290 249 [A253]: A251 A256 250 [A254]: A255 251 [A255]: A210 A254 A293 252 [A256]: A210 A211 A212 A248 A253 253 [A257]: A210 A260 A263 A293 A296 A301 254 [A258]: A248 A249 A252 A259 A262 A263 A287 A408 255 [A259]: A206 A209 A219 A220 A244 A245 A248 A249 A258 A262 A408 A412 256 [A260]: A208 A209 A216 A257 A263 A264 A296 257 [A261]: A205 A206 A262 A264 A265 A305 A308 A326 A329 A408 258 [A262]: A249 A258 A259 A261 A263 A288 A329 A332 A333 A408 259 [A263]: A210 A252 A257 A258 A260 A262 A266 A282 A288 A294 A301 260 [A264]: A205 A260 A261 A301 A304 A305 A308 261 [A265]: A261 A274 A277 A279 A305 A326 A329 262 [A266]: A263 A279 A282 A285 A288 263 [A267]: A301 264 [A268]: A271 A274 A302 A305 A309 265 [A269]: A279 266 [A270]: 267 [A271]: A268 A272 A273 A274 A309 268 [A272]: A271 A273 269 [A273]: A271 A272 A274 A309 270 [A274]: A265 A268 A271 A273 A277 A305 A309 A323 A326 271 [A275]: 272 [A276]: A277 A278 273 [A277]: A265 A274 A276 A279 A330 A363 274 [A278]: A276 A334 A359 A362 A363 275 [A279]: A265 A266 A269 A277 A285 A330 A333 A334 276 [A280]: 277 [A281]: A283 A284 278 [A282]: A263 A266 A288 279 [A283]: A281 A289 A294 280 [A284]: A281 A285 A334 A337 281 [A285]: A266 A279 A284 A288 A333 A334 A337 282 [A286]: A287 A289 A290 A400 283 [A287]: A249 A250 A258 A286 A290 A332 A333 A335 A400 A401 A404 284 [A288]: A262 A263 A266 A282 A285 A333 285 [A289]: A283 A286 286 [A290]: A251 A252 A286 A287 287 [A291]: 288 [A292]: 289 [A293]: A210 A255 A257 A294 290 [A294]: A263 A283 A293 A295 291 [A295]: A294 292 [A296]: A210 A215 A257 A260 A299 293 [A297]: 294 [A298]: 295 [A299]: A296 A301 A304 296 [A300]: A302 A303 297 [A301]: A257 A263 A264 A267 A299 298 [A302]: A268 A300 A303 299 [A303]: A300 A302 A306 300 [A304]: A264 A299 A307 301 [A305]: A261 A264 A265 A268 A274 A308 A309 A326 302 [A306]: A303 A309 A310 303 [A307]: A201 A304 A310 304 [A308]: A205 A261 A264 A305 305 [A309]: A268 A271 A273 A274 A305 A306 A319 A322 A323 A326 306 [A310]: A306 A307 307 [A311]: A201 A202 308 [A312]: A202 A317 A322 309 [A313]: A314 A319 A322 310 [A314]: A198 A313 A315 311 [A315]: A198 A199 A202 A314 A419 A422 312 [A316]: 313 [A317]: A312 A321 A322 A325 A414 A415 A418 314 [A318]: A320 A321 315 [A319]: A309 A313 A322 316 [A320]: A318 A321 317 [A321]: A317 A318 A320 A414 A418 A588 A591 318 [A322]: A309 A312 A313 A317 A319 A326 319 [A323]: A274 A309 A326 320 [A324]: 321 [A325]: A317 A326 A329 A411 A414 A415 A588 322 [A326]: A261 A265 A274 A305 A309 A322 A323 A325 A329 323 [A327]: A586 324 [A328]: A329 A364 A407 A411 A586 A588 A589 A592 325 [A329]: A261 A262 A265 A325 A326 A328 A332 A408 A411 326 [A330]: A277 A279 A363 327 [A331]: 328 [A332]: A249 A262 A287 A329 A333 A335 A404 A407 A408 329 [A333]: A262 A279 A285 A287 A288 A332 A334 330 [A334]: A278 A279 A284 A285 A333 A337 A359 A363 331 [A335]: A287 A332 A338 A360 A400 A403 A404 332 [A336]: 333 [A337]: A284 A285 A334 A356 334 [A338]: A335 A340 A350 A354 A357 A375 A400 335 [A339]: A354 336 [A340]: A338 A348 A350 A375 A376 A393 A396 A397 A400 337 [A341]: A343 338 [A342]: A343 A393 339 [A343]: A341 A342 A347 A348 A349 340 [A344]: A345 341 [A345]: A344 342 [A346]: A392 343 [A347]: A343 A390 344 [A348]: A340 A343 A376 A391 A393 A396 345 [A349]: A343 346 [A350]: A338 A340 A351 A354 A357 A368 A372 A375 A376 347 [A351]: A350 A352 A354 348 [A352]: A351 349 [A353]: 350 [A354]: A338 A339 A350 A351 A356 A357 351 [A355]: A356 352 [A356]: A337 A354 A355 353 [A357]: A338 A350 A354 A360 A361 A368 A371 A375 354 [A358]: A359 A368 355 [A359]: A278 A334 A358 A363 356 [A360]: A335 A357 A361 A364 A371 A580 357 [A361]: A357 A360 A366 A368 A371 358 [A362]: A278 A363 359 [A363]: A277 A278 A330 A334 A359 A362 A364 360 [A364]: A328 A360 A363 A366 A580 A586 A589 361 [A365]: 362 [A366]: A361 A364 A370 A371 A579 A580 A583 363 [A367]: A369 A370 364 [A368]: A350 A357 A358 A361 A369 A372 365 [A369]: A367 A368 A372 366 [A370]: A366 A367 A371 A374 A579 A582 367 [A371]: A357 A360 A361 A366 A370 A375 A576 A579 A580 368 [A372]: A350 A368 A369 369 [A373]: A374 A377 A388 370 [A374]: A370 A373 A377 A379 A388 A575 A576 A579 371 [A375]: A338 A340 A350 A357 A371 A376 A576 372 [A376]: A340 A348 A350 A375 A377 373 [A377]: A373 A374 A376 A388 A390 A391 374 [A378]: A380 A389 A391 A395 A573 375 [A379]: A374 A386 A388 A575 376 [A380]: A378 377 [A381]: 378 [A386]: A379 379 [A387]: 380 [A388]: A373 A374 A377 A379 381 [A389]: A378 A390 382 [A390]: A347 A377 A389 383 [A391]: A348 A377 A378 A395 A396 A573 384 [A392]: A346 A395 385 [A393]: A340 A342 A348 A394 A397 386 [A394]: A393 A397 387 [A395]: A378 A391 A392 A398 388 [A396]: A340 A348 A391 389 [A397]: A340 A393 A394 A398 A400 A401 390 [A398]: A395 A397 A566 A569 391 [A399]: A573 A576 392 [A400]: A286 A287 A335 A338 A340 A397 A401 393 [A401]: A250 A287 A397 A400 A405 394 [A402]: A572 395 [A403]: A335 A406 A407 A572 A576 A577 A580 396 [A404]: A287 A332 A335 397 [A405]: A246 A249 A250 A401 A570 A636 398 [A406]: A403 A407 A410 A572 A577 A593 399 [A407]: A328 A332 A403 A406 A580 A593 400 [A408]: A206 A244 A249 A258 A259 A261 A262 A329 A332 A411 A412 401 [A409]: A246 402 [A410]: A406 A413 A592 A593 403 [A411]: A325 A328 A329 A408 A414 A415 A592 404 [A412]: A203 A206 A220 A241 A244 A259 A408 A413 A415 A416 405 [A413]: A410 A412 A416 A417 406 [A414]: A317 A321 A325 A411 A415 A417 A418 A588 A591 A592 407 [A415]: A202 A206 A317 A325 A411 A412 A414 408 [A416]: A203 A239 A241 A412 A413 A417 A419 A420 409 [A417]: A413 A414 A416 A418 410 [A418]: A317 A321 A414 A417 A591 411 [A419]: A199 A202 A203 A239 A315 A416 412 [A420]: A238 A239 A416 A424 413 [A421]: 414 [A422]: A315 415 [A423]: 416 [A424]: A238 A420 417 [A425]: A235 A426 A427 418 [A426]: A425 419 [A427]: A235 A425 420 [A428]: 421 [A429]: A235 A432 422 [A430]: A230 A232 A431 423 [A431]: A150 A156 A232 A430 424 [A432]: A156 A223 A225 A240 A429 A433 A654 425 [A433]: A146 A150 A157 A159 A180 A226 A228 A432 426 [A434]: 427 [A435]: A159 A161 A173 A224 428 [A436]: A160 A223 A242 A438 A647 A651 429 [A437]: A161 A169 A170 A222 430 [A438]: A436 A439 A458 A461 431 [A439]: A219 A243 A438 A442 A454 A457 A458 432 [A440]: 433 [A441]: A455 A458 A459 A462 A552 A553 A554 434 [A442]: A219 A439 A444 A451 A454 435 [A443]: A447 A557 436 [A444]: A212 A213 A442 A447 A451 437 [A445]: 438 [A446]: A560 439 [A447]: A443 A444 A451 A557 A559 440 [A448]: A450 A564 A567 441 [A449]: A247 A450 A452 A453 A509 A564 A567 A568 A636 442 [A450]: A245 A247 A248 A251 A448 A449 A451 A567 443 [A451]: A442 A444 A447 A450 A454 A559 444 [A452]: A449 A453 A456 A499 A505 A506 A548 A550 A552 A559 A564 445 [A453]: A449 A452 A640 446 [A454]: A219 A439 A442 A451 A455 447 [A455]: A441 A454 A552 A557 A559 448 [A456]: A452 A457 A460 A496 A499 A500 A506 A640 A641 A644 A645 449 [A457]: A243 A439 A456 A644 450 [A458]: A438 A439 A441 A461 451 [A459]: A441 A492 A495 A496 A552 A553 452 [A460]: A456 A463 A496 A500 A641 A644 A645 A648 453 [A461]: A160 A438 A458 A648 454 [A462]: A441 A465 A466 A553 A660 A690 455 [A463]: A460 A467 A492 A493 A496 456 [A464]: A160 A648 A651 A652 A656 A658 457 [A465]: A106 A462 A466 A468 A469 A658 A660 A690 458 [A466]: A462 A465 A489 A492 A553 459 [A467]: A463 A489 460 [A468]: A465 A472 A656 A658 461 [A469]: A465 A473 462 [A470]: A474 A487 A489 463 [A471]: 464 [A472]: A468 A475 465 [A473]: A469 A477 A487 A701 466 [A474]: A470 A477 A478 A484 A487 467 [A475]: A472 A478 468 [A476]: A477 A479 A480 A701 A748 A750 469 [A477]: A473 A474 A476 A482 A483 A484 A486 A487 A698 A701 A743 A750 470 [A478]: A474 A475 471 [A479]: A476 A480 472 [A480]: A476 A479 A482 A701 A704 A746 A747 A748 A750 473 [A481]: A746 474 [A482]: A477 A480 A483 A743 A750 475 [A483]: A477 A482 A743 476 [A484]: A474 A477 477 [A485]: 478 [A486]: A477 479 [A487]: A470 A473 A474 A477 480 [A488]: A490 481 [A489]: A466 A467 A470 A490 A491 482 [A490]: A488 A489 A689 A692 A693 A696 483 [A491]: A489 A493 A494 484 [A492]: A459 A463 A466 A496 A553 485 [A493]: A463 A491 A494 A496 A497 486 [A494]: A491 A493 A537 487 [A495]: A459 A499 A537 A552 488 [A496]: A456 A459 A460 A463 A492 A493 A497 A500 489 [A497]: A493 A496 A500 A501 490 [A498]: A499 A505 A531 A535 A537 A538 A550 491 [A499]: A452 A456 A495 A498 A500 A505 A506 A550 A552 492 [A500]: A456 A460 A496 A497 A499 A641 A645 493 [A501]: A497 494 [A502]: A503 A507 A511 495 [A503]: A502 A507 A508 A530 496 [A504]: 497 [A505]: A452 A498 A499 A506 A523 A527 A531 A548 498 [A506]: A452 A456 A499 A505 499 [A507]: A502 A503 A508 A511 500 [A508]: A503 A507 A523 A526 A527 A530 A531 501 [A509]: A449 A510 A513 A523 A564 A565 A568 502 [A510]: A509 A513 A568 A635 A638 503 [A511]: A502 A507 A514 A515 504 [A512]: A515 A522 A523 A526 A565 505 [A513]: A509 A510 A565 A568 A569 506 [A514]: A511 A515 507 [A515]: A511 A512 A514 A516 A526 508 [A516]: A515 A517 509 [A517]: A516 510 [A518]: 511 [A519]: A521 A522 512 [A520]: A523 A562 A565 513 [A521]: A519 514 [A522]: A512 A519 A526 515 [A523]: A505 A508 A509 A512 A520 A524 A526 A527 A548 A561 A564 A565 516 [A524]: A523 A528 A561 517 [A525]: A528 A529 518 [A526]: A508 A512 A515 A522 A523 A529 519 [A527]: A505 A508 A523 A528 A531 A538 A548 520 [A528]: A524 A525 A527 A532 A538 A540 A545 A548 521 [A529]: A525 A526 522 [A530]: A503 A508 A531 523 [A531]: A498 A505 A508 A527 A530 A534 A535 A538 524 [A532]: A528 A533 A538 A540 525 [A533]: A532 A534 526 [A534]: A531 A533 527 [A535]: A498 A531 A537 528 [A536]: 529 [A537]: A494 A495 A498 A535 A551 530 [A538]: A498 A527 A528 A531 A532 A548 A550 531 [A539]: A549 A556 532 [A540]: A528 A532 A541 A545 533 [A541]: A540 A544 A547 A549 A558 534 [A542]: A543 535 [A543]: A542 536 [A544]: A541 A546 A547 537 [A545]: A528 A540 538 [A546]: A544 539 [A547]: A541 A544 A558 A560 540 [A548]: A452 A505 A523 A527 A528 A538 A550 A559 A561 A564 541 [A549]: A539 A541 A556 A558 542 [A550]: A452 A498 A499 A538 A548 A552 A559 543 [A551]: A537 A556 544 [A552]: A441 A452 A455 A459 A495 A499 A550 A557 A559 545 [A553]: A441 A459 A462 A466 A492 A689 546 [A554]: A441 547 [A555]: A556 A683 548 [A556]: A539 A549 A551 A555 549 [A557]: A443 A447 A455 A552 A559 550 [A558]: A541 A547 A549 A560 551 [A559]: A447 A451 A452 A455 A548 A550 A552 A557 A564 552 [A560]: A446 A547 A558 553 [A561]: A523 A524 A548 A564 554 [A562]: A520 555 [A563]: 556 [A564]: A448 A449 A452 A509 A523 A548 A559 A561 A567 557 [A565]: A509 A512 A513 A520 A523 A566 A569 558 [A566]: A398 A565 A569 559 [A567]: A247 A251 A448 A449 A450 A564 560 [A568]: A449 A509 A510 A513 A635 A636 561 [A569]: A398 A513 A565 A566 562 [A570]: A246 A405 A636 A639 563 [A571]: A573 A633 564 [A572]: A402 A403 A406 A577 565 [A573]: A378 A391 A399 A571 A576 566 [A574]: 567 [A575]: A374 A379 568 [A576]: A371 A374 A375 A399 A403 A573 569 [A577]: A403 A406 A572 A593 570 [A578]: 571 [A579]: A366 A370 A371 A374 A580 A582 572 [A580]: A360 A364 A366 A371 A403 A407 A579 A589 A593 573 [A581]: A593 574 [A582]: A370 A579 575 [A583]: A366 A589 A590 576 [A584]: 577 [A585]: 578 [A586]: A327 A328 A364 A588 A589 579 [A587]: 580 [A588]: A321 A325 A328 A414 A586 A591 A592 581 [A589]: A328 A364 A580 A583 A586 A590 A592 A593 582 [A590]: A583 A589 583 [A591]: A321 A414 A418 A588 584 [A592]: A328 A410 A411 A414 A588 A589 A593 585 [A593]: A406 A407 A410 A577 A580 A581 A589 A592 586 [A594]: 587 [A632]: 588 [A633]: A571 589 [A634]: A639 590 [A635]: A510 A568 A638 591 [A636]: A246 A247 A405 A449 A568 A570 A639 592 [A637]: 593 [A638]: A510 A635 A641 A642 594 [A639]: A246 A570 A634 A636 595 [A640]: A243 A453 A456 A644 596 [A641]: A456 A460 A500 A638 A642 A645 597 [A642]: A638 A641 598 [A643]: A242 A243 A646 599 [A644]: A243 A456 A457 A460 A640 A645 A648 600 [A645]: A456 A460 A500 A641 A644 601 [A646]: A242 A643 A649 602 [A647]: A223 A242 A243 A436 A648 A650 A651 603 [A648]: A460 A461 A464 A644 A647 A651 A652 604 [A649]: A646 605 [A650]: A223 A240 A242 A647 A651 606 [A651]: A158 A160 A223 A242 A436 A464 A647 A648 A650 607 [A652]: A464 A648 608 [A653]: 609 [A654]: A155 A156 A158 A432 610 [A655]: A149 A155 A157 A656 A657 611 [A656]: A160 A464 A468 A655 A657 A658 612 [A657]: A142 A145 A146 A149 A157 A159 A655 A656 A658 613 [A658]: A106 A160 A464 A465 A468 A656 A657 A660 614 [A659]: A100 A107 A139 A142 A161 A172 A660 A661 615 [A660]: A106 A108 A162 A462 A465 A658 A659 A685 A687 A690 616 [A661]: A109 A161 A167 A169 A172 A659 617 [A662]: A108 A110 A681 A682 A685 618 [A663]: A113 A164 A664 A666 A677 A681 619 [A664]: A93 A110 A111 A113 A663 A665 A673 620 [A665]: A113 A664 A667 A669 A672 621 [A666]: A663 A667 A677 622 [A667]: A665 A666 A669 623 [A668]: A113 624 [A669]: A113 A665 A667 A670 A672 625 [A670]: A113 A114 A669 626 [A671]: A93 A94 A97 A99 A112 A114 A116 627 [A672]: A665 A669 628 [A673]: A86 A90 A93 A94 A110 A664 A675 A678 629 [A674]: A675 A676 A677 630 [A675]: A20 A21 A86 A90 A673 A674 A676 631 [A676]: A21 A674 A675 632 [A677]: A164 A213 A663 A666 A674 A680 A681 633 [A678]: A673 634 [A679]: A21 A82 A86 A683 635 [A680]: A164 A213 A677 A681 A683 A684 636 [A681]: A164 A662 A663 A677 A680 637 [A682]: A85 A662 A687 A688 638 [A683]: A82 A555 A679 A680 A688 639 [A684]: A680 640 [A685]: A660 A662 A687 641 [A686]: 642 [A687]: A103 A108 A660 A682 A685 A688 A690 A691 643 [A688]: A82 A85 A682 A683 A687 A691 644 [A689]: A490 A553 A692 645 [A690]: A462 A465 A660 A687 A691 646 [A691]: A74 A80 A85 A103 A687 A688 A690 A694 647 [A692]: A490 A689 A693 648 [A693]: A490 A692 649 [A694]: A75 A691 650 [A695]: A80 651 [A696]: A490 652 [A697]: 653 [A698]: A477 A701 A743 A750 A752 654 [A699]: A700 A701 655 [A700]: A699 A702 A751 A756 656 [A701]: A473 A476 A477 A480 A698 A699 A748 A750 657 [A702]: A700 A706 A707 A710 A711 A751 A756 658 [A703]: A704 A706 A748 659 [A704]: A480 A703 A707 A725 A728 A729 A744 A747 A748 A749 660 [A705]: A708 A709 661 [A706]: A702 A703 662 [A707]: A702 A704 A711 A728 A732 A749 A751 A759 663 [A708]: A705 A709 A712 A715 A720 A724 A727 A728 664 [A709]: A705 A708 665 [A710]: A67 A702 A711 A760 A763 666 [A711]: A702 A707 A710 A714 A756 A759 A760 A763 667 [A712]: A708 A713 A715 A717 A720 668 [A713]: A712 A714 A763 A766 A767 B95 669 [A714]: A711 A713 A762 A763 A766 670 [A715]: A708 A712 A719 A720 A727 A731 671 [A716]: A719 672 [A717]: A712 673 [A718]: 674 [A719]: A715 A716 A731 675 [A720]: A708 A712 A715 A727 676 [A721]: A726 A727 A730 677 [A722]: 678 [A723]: A725 A726 679 [A724]: A708 A727 680 [A725]: A704 A723 A726 A729 681 [A726]: A721 A723 A725 A729 A730 682 [A727]: A708 A715 A720 A721 A724 A728 A730 683 [A728]: A704 A707 A708 A727 684 [A729]: A704 A725 A726 A730 A733 A744 685 [A730]: A721 A726 A727 A729 686 [A731]: A715 A719 687 [A732]: A707 A736 A742 A744 A749 A751 688 [A733]: A729 A742 A744 689 [A734]: 690 [A735]: A736 691 [A736]: A732 A735 A741 A742 A751 A755 A758 A759 692 [A737]: 693 [A738]: A740 A741 694 [A739]: A742 695 [A740]: A738 A741 A752 696 [A741]: A736 A738 A740 A742 A752 A755 697 [A742]: A732 A733 A736 A739 A741 A743 A744 A749 A751 A752 A755 698 [A743]: A477 A482 A483 A698 A742 A752 699 [A744]: A704 A729 A732 A733 A742 A749 700 [A745]: 701 [A746]: A480 A481 A747 702 [A747]: A480 A704 A746 A748 703 [A748]: A476 A480 A701 A703 A704 A747 A750 704 [A749]: A704 A707 A732 A742 A744 A751 705 [A750]: A476 A477 A480 A482 A698 A701 A748 706 [A751]: A700 A702 A707 A732 A736 A742 A749 A755 A756 A759 707 [A752]: A698 A740 A741 A742 A743 A755 708 [A753]: 709 [A754]: 710 [A755]: A736 A741 A742 A751 A752 A758 711 [A756]: A68 A78 A700 A702 A711 A751 A759 A760 712 [A757]: A78 A79 713 [A758]: A736 A755 A759 A761 A762 714 [A759]: A707 A711 A736 A751 A756 A758 A762 715 [A760]: A65 A67 A68 A710 A711 A756 A763 716 [A761]: A758 717 [A762]: A714 A758 A759 A765 718 [A763]: A67 A710 A711 A713 A714 A760 A766 A767 719 [A764]: 720 [A765]: A762 721 [A766]: A713 A714 A763 A767 B95 722 [A767]: A713 A763 A766 B95 B96 723 [A768]: A772 B116 724 [A769]: 725 [A770]: B95 B96 726 [A771]: A775 B116 727 [A772]: A768 A775 B44 B118 728 [A773]: B89 729 [A774]: A775 B93 B96 B113 730 [A775]: A771 A772 A774 B113 B118 B120 731 [A776]: A777 B42 B43 B44 B47 B89 732 [A777]: A776 A778 B42 B89 733 [A778]: A777 A781 B113 B120 B128 734 [A779]: B37 735 [A780]: 736 [A781]: A778 A782 A784 A785 B128 B148 737 [A782]: A781 738 [A783]: A786 B19 B34 B37 739 [A784]: A781 A785 B42 740 [A785]: A781 A784 A789 741 [A786]: A783 A789 A790 742 [A787]: A790 A791 B15 B18 B19 B38 B39 743 [A788]: 744 [A789]: A785 A786 A792 A794 745 [A790]: A786 A787 B18 B19 746 [A791]: A787 747 [A792]: A789 A794 748 [A793]: 749 [A794]: A789 A792 750 [A795]: 751 [B3]: B4 B75 752 [B4]: B3 B8 B12 B71 B74 B75 753 [B5]: B7 B8 754 [B6]: 755 [B7]: B5 756 [B8]: B4 B5 B11 B12 757 [B9]: B67 B71 758 [B10]: 759 [B11]: B8 B12 760 [B12]: B4 B8 B11 B39 B67 B74 761 [B13]: B16 B17 B67 762 [B14]: 763 [B15]: A787 B39 764 [B16]: B13 B27 B35 B67 B70 765 [B17]: B13 766 [B18]: A787 A790 B19 767 [B19]: A783 A787 A790 B18 B21 B27 B31 B34 B35 B38 768 [B20]: B22 B24 B64 769 [B21]: B19 B31 770 [B22]: B20 B24 B64 771 [B23]: 772 [B24]: B20 B22 B26 B64 773 [B25]: 774 [B26]: B24 B64 B66 775 [B27]: B16 B19 B31 B32 B35 B64 B70 776 [B28]: B30 B31 B64 777 [B29]: B32 B52 B55 B59 B60 B63 B65 B73 778 [B30]: B28 B31 B60 779 [B31]: B19 B21 B27 B28 B30 B34 B64 780 [B32]: B27 B29 B36 B52 B70 B73 781 [B33]: 782 [B34]: A783 B19 B31 B37 783 [B35]: B16 B19 B27 B36 B39 B70 784 [B36]: B32 B35 B37 B41 B43 B48 B51 B70 B73 B74 B77 785 [B37]: A779 A783 B34 B36 B42 B43 B45 B48 786 [B38]: A787 B19 B39 787 [B39]: A787 B12 B15 B35 B38 B74 788 [B40]: 789 [B41]: B36 B43 B77 B78 790 [B42]: A776 A777 A784 B37 791 [B43]: A776 B36 B37 B41 B47 B48 B77 792 [B44]: A772 A776 B46 B47 B118 793 [B45]: B37 B48 B118 794 [B46]: B44 795 [B47]: A776 B43 B44 B77 796 [B48]: B36 B37 B43 B45 B49 B51 B52 797 [B49]: B48 B52 B54 B55 B60 798 [B50]: B51 B54 799 [B51]: B36 B48 B50 B52 B73 B76 B77 800 [B52]: B29 B32 B48 B49 B51 B55 B73 801 [B53]: 802 [B54]: B49 B50 803 [B55]: B29 B49 B52 B59 B60 804 [B56]: 805 [B57]: 806 [B58]: 807 [B59]: B29 B55 B63 808 [B60]: B29 B30 B49 B55 809 [B61]: B62 810 [B62]: B61 811 [B63]: B29 B59 812 [B64]: B20 B22 B24 B26 B27 B28 B31 813 [B65]: B29 B69 814 [B66]: B26 B68 B69 815 [B67]: B9 B12 B13 B16 B68 B70 B71 816 [B68]: B66 B67 817 [B69]: B65 B66 B73 818 [B70]: B16 B27 B32 B35 B36 B67 B71 B73 B74 819 [B71]: B4 B9 B67 B70 B72 B74 B75 820 [B72]: B71 B73 B75 821 [B73]: B29 B32 B36 B51 B52 B69 B70 B72 822 [B74]: B4 B12 B36 B39 B70 B71 823 [B75]: B3 B4 B71 B72 824 [B76]: B51 825 [B77]: B36 B41 B43 B47 B51 826 [B78]: B41 827 [B79]: 828 [B80]: 829 [B81]: 830 [B85]: B89 831 [B86]: B89 B90 B145 832 [B87]: 833 [B88]: B89 834 [B89]: A773 A776 A777 B85 B86 B88 B145 835 [B90]: B86 B145 836 [B91]: 837 [B92]: 838 [B93]: A774 B96 B141 B144 B145 839 [B94]: 840 [B95]: A713 A766 A767 A770 B96 841 [B96]: A767 A770 A774 B93 B95 B112 842 [B97]: B104 843 [B98]: 844 [B99]: B101 845 [B100]: 846 [B101]: B99 847 [B102]: 848 [B103]: B138 849 [B104]: B97 850 [B105]: B107 B108 851 [B106]: 852 [B107]: B105 B110 853 [B108]: B105 854 [B109]: B110 855 [B110]: B107 B109 B122 B125 B126 B129 856 [B111]: B112 B115 857 [B112]: B96 B111 B113 B116 858 [B113]: A774 A775 A778 B112 B120 B125 859 [B114]: B115 B122 B125 860 [B115]: B111 B114 B116 B119 861 [B116]: A768 A771 B112 B115 862 [B117]: 863 [B118]: A772 A775 B44 B45 864 [B119]: B115 865 [B120]: A775 A778 B113 B124 B125 866 [B121]: B123 B124 867 [B122]: B110 B114 B123 868 [B123]: B121 B122 869 [B124]: B120 B121 870 [B125]: B110 B113 B114 B120 B128 871 [B126]: B110 872 [B127]: 873 [B128]: A778 A781 B125 B129 B144 874 [B129]: B110 B128 B144 875 [B130]: 876 [B131]: 877 [B132]: B144 878 [B133]: 879 [B134]: B136 B138 880 [B135]: 881 [B136]: B134 882 [B137]: 883 [B138]: B103 B134 884 [B139]: 885 [B140]: B142 B143 886 [B141]: B93 887 [B142]: B140 888 [B143]: B140 889 [B144]: B93 B128 B129 B132 B148 890 [B145]: B86 B89 B90 B93 891 [B146]: 892 [B147]: 893 [B148]: A781 B144 894 [B149]: 895 [B150]: >>> num chains = 1 <----L A[5-11]----> >>> A[8] pos1 = 1.2789 -0.2052 1.2852 >>> A[32] pos = 1.7772 -0.9392 1.1025 <----S A[12-17]----> >>> A[14] pos1 = 1.4806 -0.0653 2.7065 >>> A[67] pos = 0.0393 0.8545 2.2412 >>> A[58] pos = 1.5764 -1.3216 2.3472 >>> A[24] pos = 1.6309 0.3852 2.6407 <----L A[18-20]----> >>> A[19] pos1 = 2.2271 0.3411 3.7524 >>> A[14] pos = 1.4806 -0.0653 2.7065 <----S A[21-27]----> >>> A[24] pos1 = 1.6309 0.3852 2.6407 >>> A[679] pos = 1.1212 -0.1151 4.1085 >>> A[89] pos = 0.4823 0.6142 3.6444 <----L A[28-36]----> >>> A[32] pos1 = 1.7772 -0.9392 1.1025 >>> A[48] pos = 2.7018 0.0593 2.1464 >>> A[39] pos = 2.303 -0.1714 1.6995 <----S A[37-42]----> >>> A[39] pos1 = 2.303 -0.1714 1.6995 >>> A[48] pos = 2.7018 0.0593 2.1464 >>> A[32] pos = 1.7772 -0.9392 1.1025 <----L A[43-44]----> >>> A[43] pos1 = 2.1645 0.9388 2.6163 <----S A[45-51]----> >>> A[48] pos1 = 2.7018 0.0593 2.1464 <----L A[52-64]----> >>> A[58] pos1 = 1.5764 -1.3216 2.3472 >>> A[48] pos = 2.7018 0.0593 2.1464 >>> A[39] pos = 2.303 -0.1714 1.6995 >>> A[32] pos = 1.7772 -0.9392 1.1025 <----H A[65-69]----> >>> A[67] pos1 = 0.0393 0.8545 2.2412 >>> A[773] pos = 0.7692 1.3235 0.078 >>> A[79] pos = 0.3744 -0.3344 2.5659 >>> A[58] pos = 1.5764 -1.3216 2.3472 <----L A[70-73]----> >>> A[71] pos1 = -0.2196 0.7565 3.0557 <----H A[74-77]----> >>> A[75] pos1 = -0.3357 -0.1534 3.1323 >>> A[690] pos = -0.0533 -0.8615 3.8636 >>> A[101] pos = -0.2509 0.615 3.8766 >>> A[89] pos = 0.4823 0.6142 3.6444 <----L A[78-80]----> >>> A[79] pos1 = 0.3744 -0.3344 2.5659 >>> A[773] pos = 0.7692 1.3235 0.078 <----H A[81-97]----> >>> A[89] pos1 = 0.4823 0.6142 3.6444 >>> A[79] pos = 0.3744 -0.3344 2.5659 >>> A[58] pos = 1.5764 -1.3216 2.3472 >>> A[24] pos = 1.6309 0.3852 2.6407 >>> A[14] pos = 1.4806 -0.0653 2.7065 <----L A[98-99]----> >>> A[98] pos1 = 0.0629 1.3293 3.9376 >>> A[89] pos = 0.4823 0.6142 3.6444 <----S A[100-103]----> >>> A[101] pos1 = -0.2509 0.615 3.8766 >>> A[658] pos = -0.7157 -0.1657 4.6602 >>> A[175] pos = -0.8032 1.1273 5.3363 >>> A[145] pos = -1.6785 0.4101 4.4678 >>> A[136] pos = -0.8632 1.1608 3.7232 >>> A[115] pos = 0.197 1.8889 5.0414 >>> A[108] pos = -0.1039 0.3191 4.2892 >>> A[98] pos = 0.0629 1.3293 3.9376 <----L A[104-105]----> >>> A[104] pos1 = -0.6905 -0.1822 3.661 <----S A[106-110]----> >>> A[108] pos1 = -0.1039 0.3191 4.2892 >>> A[658] pos = -0.7157 -0.1657 4.6602 >>> A[464] pos = -0.8619 -1.2744 4.7653 >>> A[101] pos = -0.2509 0.615 3.8766 <----L A[111-119]----> >>> A[115] pos1 = 0.197 1.8889 5.0414 >>> A[668] pos = 1.2258 1.1884 5.2121 <----H A[120-128]----> >>> A[124] pos1 = -1.4022 1.6623 4.7142 <----L A[129-130]----> >>> A[129] pos1 = -2.1325 1.1624 4.2617 <----H A[131-135]----> >>> A[133] pos1 = -1.3673 0.5957 3.5234 >>> A[129] pos = -2.1325 1.1624 4.2617 <----L A[136-137]----> >>> A[136] pos1 = -0.8632 1.1608 3.7232 >>> A[133] pos = -1.3673 0.5957 3.5234 >>> A[124] pos = -1.4022 1.6623 4.7142 >>> A[71] pos = -0.2196 0.7565 3.0557 <----H A[138-152]----> >>> A[145] pos1 = -1.6785 0.4101 4.4678 >>> A[124] pos = -1.4022 1.6623 4.7142 >>> A[115] pos = 0.197 1.8889 5.0414 >>> A[101] pos = -0.2509 0.615 3.8766 <----L A[153-156]----> >>> A[154] pos1 = -2.6475 -0.3193 5.066 >>> A[145] pos = -1.6785 0.4101 4.4678 <----S A[157-162]----> >>> A[159] pos1 = -1.057 -0.033 5.1403 >>> A[658] pos = -0.7157 -0.1657 4.6602 >>> A[434] pos = -1.3436 -0.045 5.6811 >>> A[154] pos = -2.6475 -0.3193 5.066 >>> A[145] pos = -1.6785 0.4101 4.4678 <----L A[163-167]----> >>> A[165] pos1 = 0.6301 0.1391 5.5892 <----H A[168-183]----> >>> A[175] pos1 = -0.8032 1.1273 5.3363 <----L A[184-190]----> >>> A[187] pos1 = -2.2238 1.4404 6.2783 >>> A[238] pos = -1.4456 0.0539 6.5225 >>> A[231] pos = -2.9746 0.7103 5.6153 >>> A[145] pos = -1.6785 0.4101 4.4678 <----H A[191-207]----> >>> A[199] pos1 = -0.5772 0.7371 6.8189 <----L A[208-208]----> >>> A[208] pos1 = 0.5049 0.0331 6.5647 >>> A[263] pos = 1.1559 0.3795 7.4718 >>> A[219] pos = 0.4222 -0.4677 6.3024 >>> A[217] pos = 0.7255 0.0375 6.101 >>> A[213] pos = 1.5127 -0.0599 5.727 >>> A[199] pos = -0.5772 0.7371 6.8189 <----S A[208-209]----> >>> A[208] pos1 = 0.5049 0.0331 6.5647 >>> A[263] pos = 1.1559 0.3795 7.4718 >>> A[219] pos = 0.4222 -0.4677 6.3024 >>> A[217] pos = 0.7255 0.0375 6.101 >>> A[213] pos = 1.5127 -0.0599 5.727 >>> A[199] pos = -0.5772 0.7371 6.8189 <----L A[210-216]----> >>> A[213] pos1 = 1.5127 -0.0599 5.727 >>> A[295] pos = 1.78 0.625 6.9929 >>> A[263] pos = 1.1559 0.3795 7.4718 >>> A[254] pos = 2.0876 -0.5788 6.5277 <----S A[217-218]----> >>> A[217] pos1 = 0.7255 0.0375 6.101 >>> A[219] pos = 0.4222 -0.4677 6.3024 >>> A[213] pos = 1.5127 -0.0599 5.727 >>> A[165] pos = 0.6301 0.1391 5.5892 <----L A[219-220]----> >>> A[219] pos1 = 0.4222 -0.4677 6.3024 >>> A[464] pos = -0.8619 -1.2744 4.7653 >>> A[442] pos = 0.897 -0.7759 5.3454 >>> A[263] pos = 1.1559 0.3795 7.4718 >>> A[247] pos = 0.8271 -1.2007 6.9244 >>> A[217] pos = 0.7255 0.0375 6.101 >>> A[213] pos = 1.5127 -0.0599 5.727 >>> A[208] pos = 0.5049 0.0331 6.5647 <----S A[221-228]----> >>> A[224] pos1 = -1.0737 0.0988 6.1257 <----L A[229-233]----> >>> A[231] pos1 = -2.9746 0.7103 5.6153 >>> A[238] pos = -1.4456 0.0539 6.5225 <----S A[234-242]----> >>> A[238] pos1 = -1.4456 0.0539 6.5225 >>> A[231] pos = -2.9746 0.7103 5.6153 >>> A[224] pos = -1.0737 0.0988 6.1257 >>> A[187] pos = -2.2238 1.4404 6.2783 <----L A[243-244]----> >>> A[243] pos1 = -0.1162 -1.0066 6.3083 >>> A[644] pos = -0.4968 -1.4376 5.9809 >>> A[464] pos = -0.8619 -1.2744 4.7653 >>> A[442] pos = 0.897 -0.7759 5.3454 >>> A[238] pos = -1.4456 0.0539 6.5225 <----H A[245-250]----> >>> A[247] pos1 = 0.8271 -1.2007 6.9244 >>> A[464] pos = -0.8619 -1.2744 4.7653 >>> A[263] pos = 1.1559 0.3795 7.4718 >>> A[219] pos = 0.4222 -0.4677 6.3024 <----L A[251-258]----> >>> A[254] pos1 = 2.0876 -0.5788 6.5277 >>> A[566] pos = 1.2706 -1.9924 7.0005 >>> A[464] pos = -0.8619 -1.2744 4.7653 >>> A[287] pos = 1.3985 -0.6397 7.6509 <----H A[259-267]----> >>> A[263] pos1 = 1.1559 0.3795 7.4718 >>> A[407] pos = 0.0765 -0.962 7.9226 >>> A[254] pos = 2.0876 -0.5788 6.5277 >>> A[247] pos = 0.8271 -1.2007 6.9244 >>> A[243] pos = -0.1162 -1.0066 6.3083 >>> A[219] pos = 0.4222 -0.4677 6.3024 >>> A[208] pos = 0.5049 0.0331 6.5647 >>> A[199] pos = -0.5772 0.7371 6.8189 <----L A[268-270]----> >>> A[269] pos1 = 1.2385 0.7971 8.3547 >>> A[308] pos = 0.124 0.9841 7.3558 >>> A[273] pos = 0.5378 1.0802 8.834 <----H A[271-275]----> >>> A[273] pos1 = 0.5378 1.0802 8.834 >>> A[308] pos = 0.124 0.9841 7.3558 >>> A[269] pos = 1.2385 0.7971 8.3547 <----L A[276-284]----> >>> A[280] pos1 = 1.7204 0.3317 8.3959 <----H A[285-290]----> >>> A[287] pos1 = 1.3985 -0.6397 7.6509 >>> A[328] pos = 0.238 -0.2763 8.3576 >>> A[280] pos = 1.7204 0.3317 8.3959 >>> A[263] pos = 1.1559 0.3795 7.4718 <----L A[291-299]----> >>> A[295] pos1 = 1.78 0.625 6.9929 <----H A[300-316]----> >>> A[308] pos1 = 0.124 0.9841 7.3558 <----L A[317-317]----> >>> A[317] pos1 = -0.8226 0.7009 7.9302 >>> A[407] pos = 0.0765 -0.962 7.9226 >>> A[328] pos = 0.238 -0.2763 8.3576 >>> A[308] pos = 0.124 0.9841 7.3558 <----H A[318-338]----> >>> A[328] pos1 = 0.238 -0.2763 8.3576 <----L A[339-340]----> >>> A[339] pos1 = 1.8122 -1.3789 8.5892 >>> A[359] pos = 1.065 -0.423 9.161 <----S A[341-343]----> >>> A[342] pos1 = 2.0954 -2.3383 8.7436 <----L A[344-346]----> >>> A[345] pos1 = 1.8859 -3.2117 8.875 <----S A[347-349]----> >>> A[348] pos1 = 1.7036 -2.3332 8.8674 >>> A[388] pos = 0.5172 -3.0078 9.1779 >>> A[342] pos = 2.0954 -2.3383 8.7436 <----L A[350-353]----> >>> A[351] pos1 = 1.9434 -1.5237 9.3283 >>> A[371] pos = 0.6038 -1.5619 9.2055 >>> A[359] pos = 1.065 -0.423 9.161 >>> A[339] pos = 1.8122 -1.3789 8.5892 >>> A[328] pos = 0.238 -0.2763 8.3576 <----H A[354-365]----> >>> A[359] pos1 = 1.065 -0.423 9.161 >>> A[351] pos = 1.9434 -1.5237 9.3283 >>> A[339] pos = 1.8122 -1.3789 8.5892 >>> A[328] pos = 0.238 -0.2763 8.3576 <----L A[366-366]----> >>> A[366] pos1 = 0.1948 -0.9729 9.4287 >>> A[584] pos = -0.5074 -0.6237 9.5281 >>> A[577] pos = -0.0992 -1.5997 8.5372 >>> A[371] pos = 0.6038 -1.5619 9.2055 >>> A[359] pos = 1.065 -0.423 9.161 <----H A[367-376]----> >>> A[371] pos1 = 0.6038 -1.5619 9.2055 <----L A[377-377]----> >>> A[377] pos1 = 0.8342 -2.4539 8.9158 >>> A[391] pos = 1.2007 -2.6855 8.529 >>> A[388] pos = 0.5172 -3.0078 9.1779 >>> A[371] pos = 0.6038 -1.5619 9.2055 <----S A[377-380]----> >>> A[378] pos1 = 0.5498 -2.6211 8.724 >>> A[391] pos = 1.2007 -2.6855 8.529 >>> A[388] pos = 0.5172 -3.0078 9.1779 >>> A[371] pos = 0.6038 -1.5619 9.2055 <----L A[381-386]----> <----S A[387-390]----> >>> A[388] pos1 = 0.5172 -3.0078 9.1779 <----L A[391-391]----> >>> A[391] pos1 = 1.2007 -2.6855 8.529 >>> A[577] pos = -0.0992 -1.5997 8.5372 >>> A[407] pos = 0.0765 -0.962 7.9226 >>> A[378] pos = 0.5498 -2.6211 8.724 >>> A[377] pos = 0.8342 -2.4539 8.9158 >>> A[348] pos = 1.7036 -2.3332 8.8674 <----H A[392-423]----> >>> A[407] pos1 = 0.0765 -0.962 7.9226 >>> A[345] pos = 1.8859 -3.2117 8.875 <----L A[424-430]----> >>> A[427] pos1 = -2.6817 0.5313 6.7276 >>> A[407] pos = 0.0765 -0.962 7.9226 >>> A[238] pos = -1.4456 0.0539 6.5225 <----S A[431-437]----> >>> A[434] pos1 = -1.3436 -0.045 5.6811 >>> A[427] pos = -2.6817 0.5313 6.7276 >>> A[231] pos = -2.9746 0.7103 5.6153 >>> A[154] pos = -2.6475 -0.3193 5.066 >>> A[145] pos = -1.6785 0.4101 4.4678 <----L A[438-447]----> >>> A[442] pos1 = 0.897 -0.7759 5.3454 >>> A[464] pos = -0.8619 -1.2744 4.7653 >>> A[434] pos = -1.3436 -0.045 5.6811 <----H A[448-480]----> >>> A[464] pos1 = -0.8619 -1.2744 4.7653 >>> A[566] pos = 1.2706 -1.9924 7.0005 <----L A[481-491]----> >>> A[486] pos1 = -1.0345 -1.7326 2.7826 >>> A[746] pos = -2.0974 -0.5679 2.1907 <----H A[492-501]----> >>> A[496] pos1 = -0.0505 -2.0999 5.0984 >>> A[553] pos = 0.369 -1.4613 4.447 >>> A[464] pos = -0.8619 -1.2744 4.7653 <----L A[502-503]----> >>> A[502] pos1 = -0.0578 -3.0073 5.7795 >>> A[509] pos = 0.7818 -2.6047 6.3095 <----H A[504-515]----> >>> A[509] pos1 = 0.7818 -2.6047 6.3095 <----L A[516-518]----> >>> A[517] pos1 = 1.5594 -3.2202 7.2039 >>> A[509] pos = 0.7818 -2.6047 6.3095 <----H A[519-532]----> >>> A[525] pos1 = 1.6192 -3.1266 5.7741 <----L A[533-537]----> >>> A[535] pos1 = 0.7239 -2.9518 4.5731 >>> A[525] pos = 1.6192 -3.1266 5.7741 <----S A[538-539]----> >>> A[538] pos1 = 1.0319 -2.5049 4.7904 >>> A[549] pos = 1.3593 -2.0866 4.9856 >>> A[525] pos = 1.6192 -3.1266 5.7741 >>> A[496] pos = -0.0505 -2.0999 5.0984 <----L A[540-546]----> >>> A[543] pos1 = 2.5829 -2.4277 5.0222 >>> A[525] pos = 1.6192 -3.1266 5.7741 <----S A[547-551]----> >>> A[549] pos1 = 1.3593 -2.0866 4.9856 >>> A[558] pos = 1.5547 -1.7233 5.1345 >>> A[543] pos = 2.5829 -2.4277 5.0222 <----L A[552-555]----> >>> A[553] pos1 = 0.369 -1.4613 4.447 >>> A[558] pos = 1.5547 -1.7233 5.1345 >>> A[549] pos = 1.3593 -2.0866 4.9856 >>> A[496] pos = -0.0505 -2.0999 5.0984 >>> A[464] pos = -0.8619 -1.2744 4.7653 >>> A[442] pos = 0.897 -0.7759 5.3454 <----S A[556-560]----> >>> A[558] pos1 = 1.5547 -1.7233 5.1345 >>> A[553] pos = 0.369 -1.4613 4.447 >>> A[549] pos = 1.3593 -2.0866 4.9856 >>> A[538] pos = 1.0319 -2.5049 4.7904 <----L A[561-562]----> >>> A[561] pos1 = 1.6265 -2.1177 6.0025 >>> A[566] pos = 1.2706 -1.9924 7.0005 >>> A[549] pos = 1.3593 -2.0866 4.9856 >>> A[525] pos = 1.6192 -3.1266 5.7741 <----H A[563-569]----> >>> A[566] pos1 = 1.2706 -1.9924 7.0005 <----L A[570-572]----> >>> A[571] pos1 = 0.3662 -2.1386 7.6225 >>> A[644] pos = -0.4968 -1.4376 5.9809 >>> A[407] pos = 0.0765 -0.962 7.9226 >>> A[247] pos = 0.8271 -1.2007 6.9244 <----H A[573-582]----> >>> A[577] pos1 = -0.0992 -1.5997 8.5372 >>> A[571] pos = 0.3662 -2.1386 7.6225 >>> A[407] pos = 0.0765 -0.962 7.9226 >>> A[391] pos = 1.2007 -2.6855 8.529 >>> A[378] pos = 0.5498 -2.6211 8.724 <----L A[583-586]----> >>> A[584] pos1 = -0.5074 -0.6237 9.5281 >>> A[589] pos = -0.3863 -0.5938 8.5976 >>> A[366] pos = 0.1948 -0.9729 9.4287 <----H A[587-592]----> >>> A[589] pos1 = -0.3863 -0.5938 8.5976 <----L A[593-634]----> <----H A[635-653]----> >>> A[644] pos1 = -0.4968 -1.4376 5.9809 >>> A[566] pos = 1.2706 -1.9924 7.0005 >>> A[509] pos = 0.7818 -2.6047 6.3095 <----L A[654-654]----> >>> A[654] pos1 = -1.7102 -0.7145 5.2082 >>> A[434] pos = -1.3436 -0.045 5.6811 >>> A[159] pos = -1.057 -0.033 5.1403 >>> A[154] pos = -2.6475 -0.3193 5.066 <----S A[655-662]----> >>> A[658] pos1 = -0.7157 -0.1657 4.6602 >>> A[159] pos = -1.057 -0.033 5.1403 >>> A[154] pos = -2.6475 -0.3193 5.066 >>> A[145] pos = -1.6785 0.4101 4.4678 <----L A[663-673]----> >>> A[668] pos1 = 1.2258 1.1884 5.2121 >>> A[679] pos = 1.1212 -0.1151 4.1085 >>> A[165] pos = 0.6301 0.1391 5.5892 >>> A[115] pos = 0.197 1.8889 5.0414 <----H A[674-684]----> >>> A[679] pos1 = 1.1212 -0.1151 4.1085 <----L A[685-685]----> >>> A[685] pos1 = 0.375 -0.5077 4.6067 >>> A[690] pos = -0.0533 -0.8615 3.8636 >>> A[658] pos = -0.7157 -0.1657 4.6602 <----H A[686-695]----> >>> A[690] pos1 = -0.0533 -0.8615 3.8636 <----L A[696-699]----> >>> A[697] pos1 = -0.5067 -1.2129 2.8066 >>> A[486] pos = -1.0345 -1.7326 2.7826 <----S A[700-703]----> >>> A[701] pos1 = -0.9811 -0.2303 2.5195 >>> A[773] pos = 0.7692 1.3235 0.078 >>> A[749] pos = -1.2664 -0.4541 2.0794 >>> A[697] pos = -0.5067 -1.2129 2.8066 <----L A[704-704]----> >>> A[704] pos1 = -1.5619 0.101 1.8197 >>> A[749] pos = -1.2664 -0.4541 2.0794 >>> A[746] pos = -2.0974 -0.5679 2.1907 >>> A[743] pos = -1.1992 -1.0417 2.0071 >>> A[729] pos = -1.4545 -0.545 1.1917 >>> A[707] pos = -1.0829 0.2701 1.7332 >>> A[701] pos = -0.9811 -0.2303 2.5195 >>> A[464] pos = -0.8619 -1.2744 4.7653 <----H A[704-711]----> >>> A[707] pos1 = -1.0829 0.2701 1.7332 >>> A[749] pos = -1.2664 -0.4541 2.0794 >>> A[746] pos = -2.0974 -0.5679 2.1907 >>> A[743] pos = -1.1992 -1.0417 2.0071 >>> A[729] pos = -1.4545 -0.545 1.1917 >>> A[701] pos = -0.9811 -0.2303 2.5195 >>> A[464] pos = -0.8619 -1.2744 4.7653 <----L A[712-712]----> >>> A[712] pos1 = -1.0076 0.6285 1.0046 >>> A[719] pos = -1.3972 0.0134 0.2906 >>> A[713] pos = -0.6823 0.7241 0.8278 >>> A[707] pos = -1.0829 0.2701 1.7332 <----H A[712-715]----> >>> A[713] pos1 = -0.6823 0.7241 0.8278 >>> A[719] pos = -1.3972 0.0134 0.2906 >>> A[707] pos = -1.0829 0.2701 1.7332 <----L A[716-722]----> >>> A[719] pos1 = -1.3972 0.0134 0.2906 <----H A[723-736]----> >>> A[729] pos1 = -1.4545 -0.545 1.1917 <----L A[737-737]----> >>> A[737] pos1 = -0.4024 -1.1111 1.0269 <----H A[738-740]----> >>> A[739] pos1 = -0.7456 -1.3642 1.4344 >>> A[741] pos = -0.4913 -1.154 1.8392 <----L A[741-741]----> >>> A[741] pos1 = -0.4913 -1.154 1.8392 >>> A[773] pos = 0.7692 1.3235 0.078 >>> A[752] pos = -0.3794 -0.8884 2.2927 >>> A[743] pos = -1.1992 -1.0417 2.0071 >>> A[739] pos = -0.7456 -1.3642 1.4344 >>> A[729] pos = -1.4545 -0.545 1.1917 <----S A[742-744]----> >>> A[743] pos1 = -1.1992 -1.0417 2.0071 >>> A[773] pos = 0.7692 1.3235 0.078 >>> A[752] pos = -0.3794 -0.8884 2.2927 >>> A[749] pos = -1.2664 -0.4541 2.0794 >>> A[741] pos = -0.4913 -1.154 1.8392 >>> A[739] pos = -0.7456 -1.3642 1.4344 >>> A[729] pos = -1.4545 -0.545 1.1917 <----L A[745-747]----> >>> A[746] pos1 = -2.0974 -0.5679 2.1907 <----S A[748-751]----> >>> A[749] pos1 = -1.2664 -0.4541 2.0794 >>> A[746] pos = -2.0974 -0.5679 2.1907 >>> A[707] pos = -1.0829 0.2701 1.7332 >>> A[704] pos = -1.5619 0.101 1.8197 >>> A[701] pos = -0.9811 -0.2303 2.5195 >>> A[464] pos = -0.8619 -1.2744 4.7653 <----L A[752-753]----> >>> A[752] pos1 = -0.3794 -0.8884 2.2927 >>> A[773] pos = 0.7692 1.3235 0.078 >>> A[743] pos = -1.1992 -1.0417 2.0071 >>> A[741] pos = -0.4913 -1.154 1.8392 >>> A[739] pos = -0.7456 -1.3642 1.4344 >>> A[697] pos = -0.5067 -1.2129 2.8066 <----H A[754-792]----> >>> A[773] pos1 = 0.7692 1.3235 0.078 pm> # show all helices pm> #----------------- pm> domains create helices = true prefix = h color = [ 1 0 0 ] width = 2 pm> # show all sheets pm> #---------------- pm> domains create sheets = true prefix = sh color = [ 0 1 0 ] width = 2 pm> # show all loops pm> #---------------- pm> domains create loops = true prefix = lp color = [ 0 0 1 ] width = 2 pm> #graphics background color = [ 1 1 1 ] >>>>>> GlutWinExpose: win [105603e8] g_curr_win [1] q